先進医療を受けた時の費用は、以下のように取り扱われ、患者さんは一般の保険診療の場合と比べて、「先進医療に係る費用」（下の図の緑色部分）を多く負担することになります。

• 「先進医療に係る費用」は、患者さんが全額自己負担することになります。「先進医療に係る費用」は、医療の種類や病院によって異なります。
• 「先進医療に係る費用」以外の、通常の治療と共通する部分（診察・検査・投薬・入院料等）の費用は、一般の保険診療と同様に扱われます。つまり、一般保険診療と共通する部分は保険給付されるため、各健康保険制度における一部負担金を支払うこととなります。

【上記に係る例図】

（厚生労働省ホームページから抜粋、一部変更）